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欧洲杯app北京基因组所发布原核生物泛基因组数据库

发布时间:2024-10-30 04:32:02 来源:欧洲杯竞猜app官网下载 作者:欧洲杯app排行榜前十名 关注者:48人关注

欧洲杯app北京基因组所发布原核生物泛基因组数据库

  作为国家在科学技术方面的最高学术机构和全国自然科学与高新技术的综合研究与发展中心,建院以来,中国科学院时刻牢记使命,与科学共进,与祖国同行,以国家富强、人民幸福为己任,人才辈出,硕果累累,为我国科技进步、经济社会发展和做出了不可替代的重要贡献。更多简介 +

  中国科学院院级科技专项体系包括战略性先导科技专项、重点部署科研专项、科技人才专项、科技合作专项、科技平台专项5类一级专项,实行分类定位、分级管理。

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  中国科学技术大学(简称“中科大”)于1958年由中国科学院创建于北京,1970年学校迁至安徽省合肥市。中科大坚持“全院办校、所系结合”的办学方针,是一所以前沿科学和高新技术为主、兼有特色管理与人文学科的研究型大学。

  中国科学院大学(简称“国科大”)始建于1978年,其前身为中国科学院研究生院,2012年更名为中国科学院大学。国科大实行“科教融合”的办学体制,与中国科学院直属研究机构在管理体制、师资队伍、培养体系、科研工作等方面共有、共治、共享、共赢,是一所以研究生教育为主的独具特色的研究型大学。

  上海科技大学(简称“上科大”),由上海市人民政府与中国科学院共同举办、共同建设,由上海市人民政府主管,2013年经教育部正式批准。上科大秉持“服务国家发展战略,培养创新创业人才”的办学方针,实现科技与教育、科教与产业、科教与创业的融合,是一所小规模、高水平、国际化的研究型、创新型大学。

  相比于传统的比较基因组学分析,泛基因组学为开展物种基因组动力学、分类及鉴定、致病性和环境适应等研究提供了新视角。近日,中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中心)国家基因组科学数据中心开发的原核生物泛基因组数据库(ProPan)正式上线,旨在提供多物种的基因组动力学特征,为物种关键抗性和代谢相关基因鉴定及其演化规律研究提供重要的数据资源。相关研究成果以ProPan: a comprehensive database for profiling prokaryotic pan-genome dynamics为题,在线发表在Nucleic Acid Research上。

  ProPan剖析了多个原核生物物种的基因组动力学特征,并进行了基因簇核苷酸多样性计算、COG功能富集分析、31个关键代谢循环过程及图谱构建、126种物质(包括杀菌剂、抗菌药物和金属)抗性基因预测和基因存在/缺失变异分析等。目前,ProPan收集了432个属的1504个物种(23个古细菌物种、1481个细菌物种)的51,882个基因组(295个古细菌基因组、51587个细菌基因组)和182867222个基因簇。用户可以以物种作为基本单元,进行数据的浏览、搜索和下载。

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  ProPan剖析了多个原核生物物种的基因组动力学特征,并进行了基因簇核苷酸多样性计算、COG功能富集分析、31个关键代谢循环过程及图谱构建、126种物质(包括杀菌剂、抗菌药物和金属)抗性基因预测和基因存在/缺失变异分析等。目前,ProPan收集了432个属的1504个物种(23个古细菌物种、1481个细菌物种)的51,882个基因组(295个古细菌基因组、51587个细菌基因组)和182867222个基因簇。用户可以以物种作为基本单元,进行数据的浏览、搜索和下载。


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